Я слышал, что поддержка квотирования встроена в ядро, начиная с версии 1.3.8x, и теперь это часть ядра 2.0.x. Если ваша система не поддерживает квотирование, я настоятельно рекомендую обновить ядро.
В настоящее время, квотирование работает только на файловой системе ext2.